L2 分子細胞遺傳學實驗室
Molecular Cytogenetics Laboratory
實驗室主持人：陳燕彰
協同主持人：武光東
壹、背景資料
最近，染色體螢光原位雜交技術 (in situ hybridization) 大幅度改良，結合細胞遺傳學、分子生物學、螢光顯微技術及電腦影像處理，發展出新的基因篩檢及定位技術，稱為螢光染色體原位雜交技術
( Fluorescence in situ Hybridization; 簡 稱FISH ) ，基因體雜交比較法 (Comparative Genomic Hybridization ; 簡稱 CGH; Kallioniemi et al., 1992)，微陣列式基因體雜交比較技術
(array-CGH)，頻譜式染色體分析 (Spectral Autokaryotyping; 簡稱 SKY; Schrock et al., 1996) 與多色螢光染色體原位雜交技術
(multicolor/multiplex FISH; 簡稱 mFISH; Speicher et al., 1996)，為癌症研究帶來新的方向。 本核心實驗室已有CGH，SKY 與 mFISH 設備，將增設 array-CGH 及其他基因篩檢及定位技術之軟硬體，標準化及最佳化各種操作流程，並培訓研究工作人員。
一、設置緣由
1.
先前本校為執行國科會尖端計劃，已於校內建立分子細胞遺傳學實驗室，主要利用CGH技術從事癌組織基因體變化之分析；自1997年迄今，已分析超過600例各種不同的人類癌組織，尋找與癌症相關之腫瘤基因及腫瘤抑制基因，成效良好。
2. 本核心實驗室利用CGH技術分析之人類癌組織包含肝癌，鼻咽癌 ，卵巢癌 ，子宮頸癌 ，乳癌，大腸直腸癌，胃癌及腦瘤 ，在過去數年內，已完成超過600例各類標本。
3. 利用CGH分析眾多的人類癌組織，我們已從中獲得數個與癌症相關的染色體好發區域，為進一步解析這些區域內所含的致癌或抑癌基因，我們已開始著手建立較高解像力的array-CGH技術平台。
二、核心技術簡介
Fluorescence in situ
hybridization（FISH）
利用螢光標定之DNA 探針，藉由hybridization的過程，在染色體上將基因或DNA定位。
Comparative
genomic hybridization（CGH）
利用兩種不同的螢光分別標定兩種不同組織細胞的Genomic DNA ，再同時與正常的染色體進行hybridization的過程，藉由比較染色體上不同螢光間的強弱比值，而偵測基因體中之特定基因的拷貝數變異（copy
number changes）。
Spectral
karyotyping (SKY)
利用各個特異的染色體探針，以多種螢光試劑加以標定後與待測的染色體進行hybridization，利用螢光試劑光波頻譜的差異，藉由光波頻譜分析，可使得個別的染色體具有其特定的頻譜組合，並藉由軟體設定不同顏色給個別的染色體。藉由顏色區別，即可快速且正確的進行細胞的核型（karyotype）分析。
Array-based Comparative genomic hybridization (array-CGH)
基本原理同於CGH，但是將原有的染色體雜交模板替換成微陣列式的BAC
Contig，可大幅提升CGH 之解像力到100Kb。
三、服務相關之研究發展
研究目標
1. 與肝癌研究計畫合作，利用CGH與SKY技術針對原發肝癌與再發肝癌之基因體變異進行比對分析。
2. 由於惡性腫瘤之基因體常常包含許多類型之變異，且不易區分這些基因體變異與癌化過程間之因果關係，因此，我們計畫針對良性肝腫瘤及一些早期肝病變組織，如再生性結�